La 1ère rencontre du projet SHARE-OMICs s'est déroulé les mercredi 25 et jeudi 26 septembre 2024 à Paris.
Programme prévisionnel
25 septembre 2024 (rue Jean Nicot, Paris, salle RJN09)
14h - 14h15 : introduction (V. Brunaud)
14h15 - 15h15 : présentations flash des différents "omiques" (échantillons, traitement, formats des données, bases de données, qualité minimale à vérifier)
- transcriptome par V. Brunaud
- protéome par W. Bienvenut
- métabolome par Metabohub
- épigénomique par F. Legeai
- métagénomique par O. Rué
15h15 - 15h30 : discussion ; comment définir des critères de qualité dans un type de "omique"
15h30 - 15h45 : pause
15h45 - 17h : présentation flash des jeux de données identifiés par CATI
- CATI BARIC
- CATI BOOM
- CATI SysMics
26 septembre 2024 (Université Paris-Cité Bat. Bouffon, Paris, salle RH46A)
Discussion sur la réutilisation de jeux de données pour l'intégration mutli-omiques ; quels critères ?
- standards de métadonnées/ontologies
- outils pour partager les données et métadonnées
- bonnes pratiques d'analyse et de ressources : articles/revues de référence, bases de données, ...
Discussion sur le contenu de stages proposés dans le cadre du projet