Programme
9h20 - 9h30 : Introduction
9h30 - 12h30 : Bases et entrepôts de données, ontologies
- les ressources en transcriptomique [PDF]
- les ressources en protéomique [PDF]
- les ressources en métabolomique [PDF]
- exemple du mapping des lipides dans les réseaux métaboliques basé sur l’utilisation d’une ontologie [PDF]
- discussion
14h - 16h45 : Méthode d’analyse de données "omiques"
- les grand types d’analyses effectuées en transcriptomique [PDF] [PDF]
- les grand types d’analyses effectuées en métabolomique [PDF]
- exemple d’un projet d’intégration transcriptomique/métabolomique [PDF]
- quelques exemples d’intégration de données "omiques" hétérogènes par/pour les modèles de processus cellulaires [PDF]
- MetExplore et intégration de données "omiques" [PDF]
- discussion
16h45 - 17h : Conclusion
Rappel des objectifs
- produire un état de l'art sur les connaissances autour des données transcriptomiques, métabolomiques et protéomiques en détaillant les ontologies connues.
- échanger sur les analyses statistiques classiquement utilisées dans les différents pipelines d'analyses.
- produire un guideline sur les bonnes pratiques de préparation des données "omiques" et faciliter les études nécessitant des approches intégratives.